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荔园学者Colloquium第九十一期

讲座题目: 组合调控子的优化建模

主讲人：王勇 研究员 （中国科学院数学与系统科学研究院）

讲座时间：2024年8月27日上午10：30-11：30

讲座地点：深圳大学粤海校区汇星楼一号教室

内容摘要：单细胞技术的进步迅速积累了大量的多组学数据，这给细胞分类以及理解这些细胞类型的基本调控机制带来了挑战。转录因子（TFs）之间的复杂相互作用，有望形成调控单元来更好表征细胞类型。为此，我们提出了组合调控子（cRegulon）的概念并发展最优化方法来从单细胞多组学数据中识别建模 TF 组合调控，这些识别出的TF 组合模块及其相关的调控元件以及靶基因，可以注释细胞类型并阐明调控图谱。通过模拟和实际数据，我们发现cRegulon可识别出表征各种细胞类型的标志性 TF；能够阐明细胞类型的定义特征；推断 TF 组合调控方面的能力更强。

主讲人简介：王勇，现为中科院数学与系统科学研究院研究员，博士生导师。1999年从内蒙古大学数学系的数学物理专业本科学位，2002年从大连理工大学应用数学系获得运筹学与控制论硕士学位，2005年从中国科学院数学与系统科学研究院获得运筹学与控制论专业的理学博士学位。2007年入职中科院数学院，历任助研、副研和研究员。获国家基金委优秀青年（2014）和杰出青年基金（2020）资助。

研究方向：计算系统生物学，生物信息学，最优化，统计学习

欢迎师生参加！

邀请人：太阳集团官网（胡耀华）

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2024年8月15日